決勝開催日程 ： 1999年 7月17日(土) 〜 18日(日)
天候／路面 ： 曇り 一時 雨 ／ ドライ 〜 ウェット 〜 ドライ
開催コース ： グランプリコース (5,091.45m)
参加台数 ： 26台
総合優勝車両 ： 日産プリンス千葉GT-Rファルケン (スーパー耐久・クラス1)
総合優勝ドライバー ： 竹内浩典／田中哲也／近藤真彦
優勝車両走行距離 ： 3,014.1km

前年、トラブルに苦しめられてスーパー耐久クラスの優勝までも逃してしまった日産スカイラインGT-R勢。
　
第6回大会では前回の借りを返すかのような好走を見せた。
　
1台は福山英朗／大八木信行／横島久／青木孝行の4選手が駆る「ダイシンアドバンGT-R」。GTクラス勢の間に割って入り、見事に総合で3位表彰台を獲得した。
　
その上を行ったのは最終的にダイシンを退けてこの年のスーパー耐久シリーズチャンピオンに輝いた「日産プリンス千葉GT-Rファルケン」。
レギュラードライバーの竹内浩典／田中哲也の両選手に、助っ人として近藤真彦選手を加えた布陣で、磐石のレースを展開。
見事にGTクラスのマシンに5周の差をつけて、十勝24時間レース史上初となるスーパー耐久マシンの総合優勝を勝ち取った。
　
また、この年は「日産プリンス千葉GT-Rファルケン」を筆頭に、クラス2の「RSオガワADVANランサー」、クラス3の「BPビスコガンマRX-7」、クラス4「ギャザズ・ドライダー・シビック」、そしてグループNプラスクラスの「ウェスティンINTEGRA」と、十勝24時間を制したマシンが全てシリーズチャンピオンを獲得。
改めてボーナスポイントが与えられる十勝24時間レースの重要性がクローズアップされた。